詳細介紹
單堿基編輯是一種基于CRISPR系統的精準基因編輯技術,可在不誘導DNA雙鏈斷裂(DSB)的前提下,直接實現基因組中單個堿基的定向轉換。其核心突破在于規避了傳統CRISPR-Cas9依賴的DSB修復路徑(如易出錯的NHEJ),顯著提升編輯安全性與精確度。
生物學意義:58%的人類遺傳性疾病由單堿基突變(SNVs)引起,該技術為這類疾病提供了革命性治療策略。
單堿基編輯通過融合催化失活的Cas9蛋白(dCas9或切口酶nCas9)與堿基脫氨酶,形成復合物實現對目標堿基的定向修改:
脫氨反應:脫氨酶將特定堿基轉化為中間產物(如胞嘧啶→尿mi啶,腺嘌ling→次黃嘌ling)。
細胞修復:DNA修復機制將中間產物轉化為目標堿基(如尿mi啶→胸腺嘧啶,次黃嘌ling→鳥嘌ling)。
受sgRNA與PAM序列限制,有效編輯窗口通常為4-8個堿基(窗口位置因編輯器類型而異)。
染色質結構(如異染色質區)可能降低編輯效率。
類型 | 脫氨酶 | 堿基轉換 | 技術里程碑 | 優化策略 |
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胞嘧啶堿基編輯器(CBE) | APOBEC1/CDA/AID | C→T / G→A | 2016年David Liu團隊開發(BE1-BE4) | 融合UGI抑制尿mi啶糖基化酶 |
腺嘌ling堿基編輯器(ABE) | TadA+ | A→G / T→C | 2017年David Liu團隊開發 | 工程化TadA*7.10高活性變體 |
鳥嘌ling堿基編輯器(GBE) | 胞嘧啶脫氨酶+UNG | C→G / G→C | 2021年Zhao等開發 | 聯合糖基化酶促C→G轉換 |
先導編輯器(PE) | 逆轉錄酶+切口酶nCas9 | 多堿基編輯 | 2019年Anzalone等開發 | pegRNA設計優化編輯范圍 |
編輯效率提升:
引入UNG抑制蛋白(如UGI),阻止尿mi啶被錯誤修復,使CBE效率提高3倍。
雙AAV載體遞送系統解決大片段編輯器包裝難題(如PE系統>6kb)。
脫靶控制:
高保真Cas9變體(HypaCas9)降低非特異性結合。
RNA脫靶抑制劑(如SECURE-BE)阻斷編輯器與游離RNA結合。
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